พิพิธภัณฑ์วัดพระรูปนี้ได้เกิดขึ้นจากดำริของหลวงพ่อพระครูสุนทรสุวรรณกิจ หรือ "หลวงพ่อดี" ซึ่งท่านริเริ่มสร้างอาคารเพื่อจัดเก็บโบราณวัตถุของวัดพระรูป ซึ่งมีโบราณวัตถุชิ้นสำคัญก็คือ "พระพุทธบาทไม้" ซึ่งถือว่าเปป็นศิลปะที่พรั่งพร้อมไปด้วยคุณค่าของชาวสุพรรณตั้งแต่โบราณมาแล้ว ซึ่งจัดแสดงในอาคารที่แบ่งส่วนมาจากหอสวดมนต์